Jakub obecnie reprezentuje barwy Lechii Gdańsk. Jednak dorastał i uczył się w Ostródzie.
Jakub Kapuściński znalazł się w gronie zawodników powołanych na zgrupowanie reprezentacji Polski do lat 16 (7-15 kwietnia), w którego trakcie Biało-Czerwoni rozegrają trzy mecze towarzyskie.
Podopieczni Przemysława Małeckiego podczas zgrupowania zagrają spotkania towarzyskie przeciwko Holandii (10 kwietnia, godz. 15:00, Buftea), Czechom (12 kwietnia, godz. 15:00, Buftea) oraz Rumunii (14 kwietnia, godz. 18:00, Mogoșoaia). To kolejne powołanie do reprezentacji Polski dla zawodnika z rocznika 2002, który na co dzień trenuje i występuje w zespołach Juniorów Młodszych Akademii Lechii